在線質譜儀由離子源、質譜儀、離子檢測器組成。儀器按用途分為同位素質譜儀、無機質譜儀、有機質譜儀；按分辨能力分為高、中、低分辨質譜儀；按其工作原理可分為靜態和動態兩類。打開質譜儀左下角的電源開關，就能聽到質譜中溶劑開關開關的聲音。大約過了兩分鐘，聽到第二聲溶劑閥切換的聲音（表示質譜自檢完成），這意味著儀器的自檢完成，可以聯機了。儀器模塊的不同的顏色代表了儀器的不同狀態：